V roce 2010 onemocnělo v České republice klíšťovou encefalitidou podle Státního zdravotního ústavu 589 lidí, což je o 227 méně než v roce 2009. Podle průzkumu společnosti Gfk z roku 2009 bylo proti nemoci očkováno 16 % obyvatel ve věku nad 50 let. Proočkovanost věkové kategorie 50 až 59 let dosáhla 12 %, pro věkovou skupinu 60 až 69 let dosáhla 15 %. Nejlépe chráněnou skupinou byly děti ve věku 7 až 12, zde proočkovanost v roce 2009 činila 36 %.
Zdroj: ČIA, 17.3.